Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCAP28676 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCAP28676 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCAP28676 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCAP28676 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCAP28676 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCAP28676 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCAP28676 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCAP28676 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCAP28676 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCAP28676 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCAP28676 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCAP28676 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCAP28676 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCAP28676 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCAP28676 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCAP28676 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCAP28676 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCAP28676 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCAP28676 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCAP28676 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCAP28676 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCAP28676 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCAP28676 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCAP28676 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCAP28676 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GCAP28676 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCAP28676 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCAP28676 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCAP28676 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCAP28676 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCAP28676 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GCAP28676 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCAP28676 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCAP28676 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCAP28676 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCAP28676 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCAP28676 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCAP28676 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCAP28676 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCAP28676 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCAP28676 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCAP28676 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCAP28676 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCAP28676 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCAP28676 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCAP28676 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCAP28676 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCAP28676 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCAP28676 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCAP28676 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCAP28676 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCAP28676 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCAP28676 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCAP28676 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCAP28676 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCAP28676 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCAP28676 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GCAP28676 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GCAP28676 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCAP28676 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCAP28676 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCAP28676 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCAP28676 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms