Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO2P25791 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO2P25791 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO2P25791 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO2P25791 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO2P25791 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO2P25791 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO2P25791 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO2P25791 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO2P25791 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO2P25791 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO2P25791 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO2P25791 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO2P25791 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO2P25791 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO2P25791 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO2P25791 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO2P25791 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO2P25791 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO2P25791 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO2P25791 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO2P25791 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO2P25791 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO2P25791 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO2P25791 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO2P25791 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO2P25791 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO2P25791 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO2P25791 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO2P25791 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO2P25791 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO2P25791 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO2P25791 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO2P25791 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO2P25791 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO2P25791 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO2P25791 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO2P25791 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO2P25791 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO2P25791 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO2P25791 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO2P25791 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO2P25791 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms