Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA6AP0CW24 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNMA6AP0CW24 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms