Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MT-CO1P00395 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-CO1P00395 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms