Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNE2O96020 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE2O96020 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNE2O96020 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNE2O96020 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNE2O96020 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNE2O96020 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNE2O96020 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191 ms