Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
C6orf47O95873 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C6orf47O95873 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms