Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms