Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD3Q9Y597 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms