Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX13Q9UN79 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX13Q9UN79 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms