Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC17A6Q9P2U8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A6Q9P2U8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms