Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TVP23BQ9NYZ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23BQ9NYZ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms