Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHK1Q9NYA1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms