Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO8Q9NRD0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO8Q9NRD0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms