Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms