Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms