Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC3Q9BY71 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms