Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRA6Q9BX79 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms