Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GORASP1Q9BQQ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GORASP1Q9BQQ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms