Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HHIPQ96QV1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HHIPQ96QV1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.6 ms