Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPRD1AQ96P16 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms