Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RCN3Q96D15 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCN3Q96D15 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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