Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2H4Q92759 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H4Q92759 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H4Q92759 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H4Q92759 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2H4Q92759 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H4Q92759 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms