Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE23Q8NDY6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms