Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTD1Q8N815 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms