Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CWC27Q6UX04 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC27Q6UX04 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms