Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI3KQ59H18 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI3KQ59H18 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms