Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HIF1AQ16665 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIF1AQ16665 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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