Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF1Q14990 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms