Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 ELC1YPL046C 300 nt4□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 YDC1YPL087W 954 nt4□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 TUP1YCR084C 2142 nt4□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 YNR065CYNR065C 3351 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 NUP1YOR098C 3231 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 SIT1YEL065W 1887 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 YCR006CYCR006C 474 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 MDY2YOL111C 639 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 PZF1YPR186C 1290 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 RPO26YPR187W 468 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 CTT1YGR088W 1689 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 NTA1YJR062C 1374 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 YNL095CYNL095C 1929 nt3.99□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 SEC18YBR080C 2277 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 SET5YHR207C 1581 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 BRE4YDL231C 3378 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 CDC12YHR107C 1224 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 PER33YLR064W 822 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 YAR030CYAR030C 342 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 YNL194CYNL194C 906 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 GDT1YBR187W 843 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 BUD14YAR014C 2130 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 BNA5YLR231C 1362 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 CYM1YDR430C 2970 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 CYK3YDL117W 2658 nt3.98□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 MCX1YBR227C 1563 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 CDC48YDL126C 2508 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 ATG7YHR171W 1893 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 YDR396WYDR396W 501 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 YGL152CYGL152C 678 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 SUI1YNL244C 327 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 DPB2YPR175W 2070 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 ARO80YDR421W 2853 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 PHO90YJL198W 2646 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 PMT2YAL023C 2280 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 AAP1YHR047C 2571 nt3.97□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 MSS116YDR194C 1995 nt3.96□□□□□ -1.77
VPS68Q12016 PDR12YPL058C 4536 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YHR145CYHR145C 357 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 TEF4YKL081W 1239 nt3.96□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YOL075CYOL075C 3885 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 PAP1YKR002W 1707 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 MID2YLR332W 1131 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 ECM33YBR078W 1290 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 TFC7YOR110W 1308 nt3.95□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 PEP5YMR231W 3090 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 PRD1YCL057W 2139 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YGL185CYGL185C 1140 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YML131WYML131W 1098 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 EOS1YNL080C 1101 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 NRM1YNR009W 750 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 SEC2YNL272C 2280 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 VPS72YDR485C 2388 nt3.94□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 EIS1YMR031C 2532 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YCR023CYCR023C 1836 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 PMA1YGL008C 2757 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 HXT7YDR342C 1713 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 HXT6YDR343C 1713 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 EXO70YJL085W 1872 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 HSP30YCR021C 999 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 THI13YDL244W 1023 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 THI11YJR156C 1023 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 KIN4YOR233W 2403 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 ISR1YPR106W 1332 nt3.93□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 AHA1YDR214W 1053 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 LSB1YGR136W 726 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YKE4YIL023C 1041 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YJR096WYJR096W 849 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 COX17YLL009C 210 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 TAF11YML015C 1041 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 SEC17YBL050W 879 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YPL025CYPL025C 558 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 SLX1YBR228W 915 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 RPG1YBR079C 2895 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 ABF1YKL112W 2196 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 RAD53YPL153C 2466 nt3.92□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 PEX29YDR479C 1665 nt3.91□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 ELO2YCR034W 1044 nt3.91□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YDL094CYDL094C 510 nt3.91□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 CNN1YFR046C 1086 nt3.91□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 YJL215CYJL215C 360 nt3.91□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 CBT1YKL208W 816 nt3.91□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 SEC72YLR292C 582 nt3.91□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 PBN1YCL052C 1251 nt3.91□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 ARO10YDR380W 1908 nt3.91□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 ARH1YDR376W 1482 nt3.91□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 MMT1YMR177W 1533 nt3.9□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 TDA7YNL176C 1911 nt3.9□□□□□ -1.78
VPS68Q12016 CWC2YDL209C 1020 nt3.9□□□□□ -1.79
VPS68Q12016 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt3.9□□□□□ -1.79
VPS68Q12016 POP3YNL282W 588 nt3.9□□□□□ -1.79
VPS68Q12016 APM4YOL062C 1476 nt3.9□□□□□ -1.79
VPS68Q12016 BUD8YLR353W 1812 nt3.9□□□□□ -1.79
VPS68Q12016 MTR10YOR160W 2919 nt3.9□□□□□ -1.79
VPS68Q12016 LOS1YKL205W 3303 nt3.9□□□□□ -1.79
VPS68Q12016 AIP1YMR092C 1848 nt3.89□□□□□ -1.79
VPS68Q12016 AIM21YIR003W 2040 nt3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms