Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FLI1Q01543 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FLI1Q01543 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms