Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORDQ00796 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORDQ00796 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORDQ00796 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORDQ00796 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORDQ00796 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORDQ00796 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORDQ00796 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORDQ00796 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORDQ00796 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORDQ00796 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORDQ00796 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORDQ00796 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORDQ00796 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORDQ00796 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORDQ00796 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORDQ00796 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORDQ00796 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SORDQ00796 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORDQ00796 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORDQ00796 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORDQ00796 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORDQ00796 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORDQ00796 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORDQ00796 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SORDQ00796 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORDQ00796 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORDQ00796 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORDQ00796 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORDQ00796 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORDQ00796 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORDQ00796 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORDQ00796 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORDQ00796 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORDQ00796 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORDQ00796 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms