Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOAP61586 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOAP61586 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOAP61586 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOAP61586 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOAP61586 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOAP61586 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOAP61586 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOAP61586 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOAP61586 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOAP61586 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOAP61586 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOAP61586 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOAP61586 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOAP61586 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOAP61586 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOAP61586 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOAP61586 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOAP61586 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOAP61586 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOAP61586 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOAP61586 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOAP61586 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOAP61586 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOAP61586 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOAP61586 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOAP61586 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOAP61586 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOAP61586 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOAP61586 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOAP61586 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOAP61586 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOAP61586 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOAP61586 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOAP61586 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOAP61586 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOAP61586 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOAP61586 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOAP61586 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOAP61586 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOAP61586 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOAP61586 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOAP61586 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOAP61586 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOAP61586 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOAP61586 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOAP61586 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOAP61586 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOAP61586 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOAP61586 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOAP61586 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOAP61586 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOAP61586 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOAP61586 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOAP61586 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOAP61586 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOAP61586 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOAP61586 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOAP61586 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOAP61586 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOAP61586 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOAP61586 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOAP61586 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOAP61586 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOAP61586 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms