Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00205P59089 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00205P59089 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms