Protein–RNA interactions for Protein: P57081

WDR4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4P57081 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR4P57081 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR4P57081 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR4P57081 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR4P57081 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR4P57081 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR4P57081 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR4P57081 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR4P57081 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR4P57081 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR4P57081 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR4P57081 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR4P57081 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR4P57081 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR4P57081 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR4P57081 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR4P57081 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR4P57081 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR4P57081 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR4P57081 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR4P57081 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR4P57081 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR4P57081 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR4P57081 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR4P57081 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR4P57081 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR4P57081 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR4P57081 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR4P57081 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR4P57081 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR4P57081 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR4P57081 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR4P57081 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR4P57081 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR4P57081 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR4P57081 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR4P57081 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR4P57081 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR4P57081 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR4P57081 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR4P57081 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR4P57081 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR4P57081 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR4P57081 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR4P57081 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR4P57081 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR4P57081 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR4P57081 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR4P57081 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR4P57081 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR4P57081 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR4P57081 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR4P57081 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR4P57081 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR4P57081 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR4P57081 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR4P57081 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR4P57081 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR4P57081 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR4P57081 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR4P57081 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR4P57081 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR4P57081 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms