Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA3P35244 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA3P35244 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA3P35244 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA3P35244 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA3P35244 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA3P35244 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA3P35244 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA3P35244 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA3P35244 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA3P35244 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA3P35244 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA3P35244 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA3P35244 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA3P35244 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA3P35244 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA3P35244 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA3P35244 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA3P35244 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA3P35244 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA3P35244 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA3P35244 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA3P35244 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA3P35244 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA3P35244 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPA3P35244 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA3P35244 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA3P35244 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA3P35244 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA3P35244 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA3P35244 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA3P35244 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA3P35244 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA3P35244 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA3P35244 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA3P35244 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA3P35244 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA3P35244 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA3P35244 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA3P35244 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA3P35244 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA3P35244 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA3P35244 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA3P35244 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA3P35244 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA3P35244 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA3P35244 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA3P35244 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA3P35244 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA3P35244 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA3P35244 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA3P35244 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA3P35244 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms