Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR7P32248 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR7P32248 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR7P32248 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR7P32248 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR7P32248 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR7P32248 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR7P32248 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR7P32248 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR7P32248 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR7P32248 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR7P32248 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR7P32248 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR7P32248 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR7P32248 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR7P32248 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCR7P32248 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCR7P32248 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR7P32248 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR7P32248 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR7P32248 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR7P32248 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR7P32248 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR7P32248 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR7P32248 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR7P32248 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR7P32248 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR7P32248 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR7P32248 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR7P32248 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR7P32248 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR7P32248 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR7P32248 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR7P32248 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR7P32248 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR7P32248 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR7P32248 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR7P32248 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR7P32248 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR7P32248 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR7P32248 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR7P32248 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR7P32248 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR7P32248 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR7P32248 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR7P32248 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR7P32248 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR7P32248 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR7P32248 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR7P32248 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR7P32248 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR7P32248 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR7P32248 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR7P32248 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR7P32248 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR7P32248 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR7P32248 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR7P32248 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR7P32248 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR7P32248 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR7P32248 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.1 ms