Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRDX6P30041 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDX6P30041 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms