Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms