Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB1P16220 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB1P16220 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB1P16220 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB1P16220 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB1P16220 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB1P16220 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB1P16220 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB1P16220 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB1P16220 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB1P16220 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB1P16220 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB1P16220 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB1P16220 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB1P16220 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB1P16220 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB1P16220 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB1P16220 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB1P16220 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB1P16220 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB1P16220 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB1P16220 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB1P16220 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB1P16220 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB1P16220 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB1P16220 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB1P16220 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB1P16220 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB1P16220 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB1P16220 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB1P16220 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB1P16220 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB1P16220 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB1P16220 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB1P16220 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB1P16220 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB1P16220 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB1P16220 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB1P16220 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB1P16220 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB1P16220 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB1P16220 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB1P16220 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB1P16220 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB1P16220 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB1P16220 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB1P16220 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB1P16220 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB1P16220 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB1P16220 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB1P16220 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB1P16220 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB1P16220 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB1P16220 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB1P16220 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB1P16220 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB1P16220 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB1P16220 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB1P16220 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB1P16220 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB1P16220 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms