Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD2P13995 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD2P13995 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTHFD2P13995 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms