Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PABPC1P11940 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms