Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGAMP11215 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAMP11215 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms