Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49CP0CI26 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms