Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESR1P03372 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ESR1P03372 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESR1P03372 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESR1P03372 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ESR1P03372 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESR1P03372 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESR1P03372 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESR1P03372 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESR1P03372 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESR1P03372 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESR1P03372 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESR1P03372 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESR1P03372 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESR1P03372 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESR1P03372 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESR1P03372 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESR1P03372 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESR1P03372 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESR1P03372 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESR1P03372 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESR1P03372 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESR1P03372 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ESR1P03372 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESR1P03372 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESR1P03372 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESR1P03372 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESR1P03372 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ESR1P03372 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESR1P03372 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESR1P03372 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESR1P03372 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESR1P03372 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESR1P03372 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESR1P03372 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESR1P03372 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESR1P03372 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESR1P03372 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESR1P03372 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESR1P03372 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESR1P03372 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESR1P03372 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESR1P03372 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ESR1P03372 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESR1P03372 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESR1P03372 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESR1P03372 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESR1P03372 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ESR1P03372 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ESR1P03372 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESR1P03372 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESR1P03372 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESR1P03372 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESR1P03372 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ESR1P03372 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ESR1P03372 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESR1P03372 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESR1P03372 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESR1P03372 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESR1P03372 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESR1P03372 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms