Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN7O94888 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms