Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC3O15379 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC3O15379 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms