Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP73O15350 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP73O15350 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP73O15350 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP73O15350 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP73O15350 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP73O15350 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP73O15350 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP73O15350 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TP73O15350 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TP73O15350 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TP73O15350 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TP73O15350 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TP73O15350 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TP73O15350 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TP73O15350 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP73O15350 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP73O15350 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP73O15350 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP73O15350 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP73O15350 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP73O15350 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP73O15350 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TP73O15350 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TP73O15350 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP73O15350 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TP73O15350 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP73O15350 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP73O15350 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP73O15350 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP73O15350 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP73O15350 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP73O15350 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP73O15350 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP73O15350 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP73O15350 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TP73O15350 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TP73O15350 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP73O15350 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP73O15350 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP73O15350 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP73O15350 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP73O15350 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP73O15350 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TP73O15350 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP73O15350 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TP73O15350 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP73O15350 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP73O15350 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP73O15350 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP73O15350 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP73O15350 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP73O15350 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP73O15350 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP73O15350 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP73O15350 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TP73O15350 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TP73O15350 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TP73O15350 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TP73O15350 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TP73O15350 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP73O15350 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP73O15350 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP73O15350 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP73O15350 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP73O15350 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP73O15350 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP73O15350 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP73O15350 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP73O15350 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP73O15350 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TP73O15350 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TP73O15350 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms