Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1C5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1C5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1C5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1C5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1C5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1C5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1C5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H7C1C5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1C5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1C5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1C5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1C5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1C5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1C5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1C5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1C5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1C5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H7C1C5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H7C1C5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1C5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1C5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1C5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1C5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1C5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1C5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1C5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1C5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1C5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H7C1C5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1C5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1C5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1C5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1C5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1C5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1C5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1C5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1C5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1C5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H7C1C5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1C5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1C5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1C5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1C5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1C5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1C5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1C5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H7C1C5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H7C1C5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H7C1C5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
H7C1C5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H7C1C5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H7C1C5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1C5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1C5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1C5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1C5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1C5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1C5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1C5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1C5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1C5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1C5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H7C1C5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms