Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB6Q9Y5E3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB6Q9Y5E3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms