Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms